MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98

Total Repeats: 12220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013450	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013450	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013450	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013450	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013450	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013450	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013450	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013450	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013450	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013450	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013450	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013450	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013450	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013450	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013450	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013450	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013450	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013450	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013450	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013450	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013450	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013450	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013450	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013450	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013450	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013450	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013450	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013450	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013450	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013450	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013450	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013450	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013450	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013450	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013450	A	7	7	9676	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013450	CAC	2	6	10469	10474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013450	CCA	2	6	10489	10494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013450	TAA	2	6	10497	10502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013450	TCT	2	6	10531	10536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013450	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013450	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013450	ATT	3	9	10673	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013450	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013450	ACA	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013450	ATA	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013450	AAG	2	6	10858	10863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013450	TAA	2	6	12484	12489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013450	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013450	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013450	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013450	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013450	T	7	7	12716	12722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013450	A	6	6	12730	12735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013450	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013450	ATA	2	6	12755	12760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013450	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013450	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013450	ATA	2	6	14149	14154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013450	GTG	2	6	14164	14169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013450	T	7	7	14186	14192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013450	AAC	2	6	14228	14233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013450	CAA	2	6	14281	14286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013450	ATG	2	6	14299	14304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013450	TAT	2	6	14344	14349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013450	A	6	6	14365	14370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013450	GTA	2	6	14385	14390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013450	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013450	GAT	3	9	14425	14433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013450	TCA	2	6	14469	14474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013450	A	6	6	14483	14488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013450	AAC	2	6	14509	14514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013450	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013450	GAT	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013450	TAT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013450	T	6	6	14683	14688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013450	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013450	AGG	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013450	TCA	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013450	CTT	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013450	T	7	7	16088	16094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013450	AGG	2	6	16100	16105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013450	TA	3	6	17088	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013450	CTA	2	6	17110	17115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013450	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013450	AAT	2	6	17211	17216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013450	CA	3	6	17234	17239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013450	TTA	2	6	17285	17290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013450	ATA	2	6	17354	17359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013450	AAT	2	6	22187	22192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013450	GAT	2	6	22199	22204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013450	AT	3	6	22242	22247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013450	TA	3	6	23737	23742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013450	AGG	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013450	TTTG	2	8	23804	23811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013450	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013450	GAT	2	6	23890	23895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013450	AAG	2	6	23909	23914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013450	TAA	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013450	ATT	2	6	24021	24026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013450	ATA	2	6	24027	24032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013450	TTC	2	6	24072	24077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013450	A	6	6	24078	24083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013450	A	6	6	24101	24106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013450	ATCT	2	8	24139	24146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013450	CGG	2	6	24197	24202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013450	T	6	6	24235	24240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013450	GCCT	2	8	24267	24274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013450	T	7	7	24343	24349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013450	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013450	AT	3	6	24375	24380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013450	TTA	2	6	24492	24497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013450	TTC	2	6	24529	24534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013450	CCA	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013450	TCC	2	6	24553	24558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013450	AAT	2	6	24590	24595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013450	ATTT	2	8	24599	24606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013450	TAT	2	6	24651	24656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013450	TCA	2	6	24670	24675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013450	CCG	2	6	24701	24706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013450	TAA	2	6	24715	24720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013450	A	6	6	24719	24724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013450	AT	3	6	24730	24735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013450	TA	3	6	24781	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013450	T	6	6	24855	24860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013450	A	6	6	24885	24890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013450	ATA	2	6	24898	24903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013450	TAA	2	6	29600	29605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013450	TCA	2	6	29621	29626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013450	TAA	2	6	29787	29792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013450	ATA	2	6	29861	29866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013450	AG	3	6	29951	29956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013450	CTG	2	6	30807	30812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013450	GAC	2	6	30816	30821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013450	T	6	6	30834	30839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013450	TGG	2	6	30847	30852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013450	TGT	2	6	30861	30866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013450	A	6	6	30893	30898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013450	AAT	2	6	30925	30930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013450	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013450	ATA	2	6	30967	30972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013450	AT	3	6	33326	33331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013450	TAC	2	6	33341	33346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013450	T	7	7	33377	33383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013450	A	6	6	33388	33393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013450	TAA	2	6	33437	33442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013450	ATG	2	6	34097	34102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013450	A	6	6	34176	34181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013450	GAG	2	6	34190	34195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013450	ATA	2	6	34196	34201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013450	TGG	2	6	34219	34224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013450	TTCA	2	8	34239	34246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013450	AT	3	6	34247	34252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013450	AT	3	6	34256	34261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013450	AGT	2	6	34286	34291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013450	CTT	2	6	34355	34360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013450	TTA	2	6	34368	34373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013450	ATAA	2	8	34445	34452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013450	ATAA	2	8	34455	34462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013450	ATCA	2	8	34580	34587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_013450	T	6	6	34600	34605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013450	AAT	2	6	34622	34627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013450	TAA	2	6	34671	34676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013450	TTTTA	2	10	36461	36470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013450	CA	3	6	36501	36506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_013450	AACA	2	8	36507	36514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_013450	AGG	2	6	36516	36521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013450	TCC	2	6	36532	36537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_013450	TTA	2	6	36544	36549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013450	ATTG	2	8	36626	36633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013450	TG	3	6	36632	36637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013450	ATT	2	6	36976	36981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013450	CTA	2	6	37002	37007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_013450	ACT	2	6	37067	37072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_013450	AAT	2	6	37204	37209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_013450	TCT	2	6	37237	37242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_013450	TCA	2	6	37298	37303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_013450	CATA	2	8	37333	37340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_013450	TTG	2	6	37342	37347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013450	TAT	2	6	37358	37363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013450	AT	3	6	38448	38453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013450	TAA	2	6	39629	39634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013450	GTT	2	6	39640	39645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013450	GTGTT	2	10	42271	42280	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013450	GTT	2	6	42326	42331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013450	CAG	2	6	42389	42394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_013450	CTG	2	6	42425	42430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_013450	ACAA	2	8	60296	60303	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
277	NC_013450	AT	3	6	60310	60315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_013450	TTA	2	6	60317	60322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013450	TTAT	2	8	60336	60343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_013450	AAT	2	6	60350	60355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013450	ATTT	2	8	60445	60452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013450	A	6	6	60923	60928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013450	A	7	7	60956	60962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_013450	TAA	2	6	61028	61033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_013450	A	6	6	61032	61037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013450	A	6	6	61039	61044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013450	TGC	2	6	61049	61054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_013450	TAA	2	6	61069	61074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_013450	ATA	2	6	65331	65336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013450	TAT	2	6	65356	65361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013450	A	6	6	65364	65369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_013450	CTTT	2	8	65390	65397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_013450	GAG	2	6	103551	103556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_013450	TAA	2	6	112300	112305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_013450	TAAA	2	8	115579	115586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_013450	TA	3	6	115592	115597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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